怎样选择
在线保护柱，又不影响分离分析？这是色谱工作者经常提出的一个问题。通常，在选择保护柱之前首先要考虑的是样品是否清洁。对于大部分分析工作者来说，一只1cm长的保护柱便能提供充分的保护作用。但是，如果样品非常不清洁，或工作中发现要经常更换1cm的保护柱，那么就应选择2cm或3cm长的保护柱。保护柱越长，自然所装填的色谱填料越多，则其越能避免污染物进入分析色谱柱的机会。当然，随着保护柱的长度加长，样品的保留时间会比使用短保护柱长。一般来说，保护柱的内径与分析色谱柱的内径相同或相当即可。
在线保护柱的使用与维护：
a.保护柱的使用
一个新的保护柱芯是没有方向的，但是从初次使用时开始保护柱芯，就赋予了方向，因为固体颗粒物质和强保留物质总是从入口端到达保护柱，并在这一端开始累积。所以柱芯在开始使用后应确认好方向。
当发现分析过程出现柱压太高、柱效下降或分离度下降等影响分离的因素的时候，需要对保护柱进行维护，如在维护之后还是没有得到改善则应考虑更换色谱柱。
b.保护柱的维护方法
先在柱套上做好标记，确认保护柱芯的正反方向；取下保护柱，在不打开卡套的前提下将保护柱反接（注意此时不能接色谱柱），用甲醇：水=20：80以3ml/min流速冲洗10min，然后再用纯甲醇以3ml/min流速冲洗10min；然后，在冲完以后将保护柱正接，打开泵除去保护柱和连接管内的空气，再连接好色谱柱，像往常一样使用。
